Фамилия Урдун — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию без каких-либо суффиксов, в чистом виде. Это так называемая «неоформленная» фамилия, характерная в основном для украинской, белорусской и южнорусской традиции, где фамилии часто закреплялись прямо из прозвища, минуя притяжательные суффиксы -ов/-ев или -ин. В русской среде такое явление встречается реже, поэтому Урдун сразу выделяется на фоне привычных Урдуновых или Урдуниных.

Само слово «урдун» имеет несколько возможных корней, и здесь мы вступаем в область диалектной лексики. Самая прямая версия — связь с тюркскими языками, где «урду» (ordu) означает «ставка хана», «военный лагерь», «армия». От этого же корня происходит слово «орда» и имя Урдун могло быть прозвищем воина, кочевника или человека, имевшего отношение к военной организации. Вторая, менее очевидная версия — местный русский диалектизм. В некоторых говорах (например, псковских и тверских) «урдун» могли называть ворчуна, брюзгу или неуживчивого человека. Слово созвучно глаголу «урдеть» — «ворчать, браниться».

Поскольку фамилия встречается крайне редко, а в старых переписных книгах и ревизских сказках она почти не фиксируется, можно предположить, что её носители происходят из южных или юго-восточных регионов России, где было сильно тюркское влияние, или из казачьей среды. Там прозвища нередко закреплялись без изменений. В любом случае, Урдун — это фамилия-прозвище, которая указывает на характер, род занятий или происхождение предка, и её носителям стоит искать корни не в центральных помещичьих губерниях, а на пограничье степей.