Фамилия Устяхина образована от имени Устяха — просторечной, обиходной формы церковного имени Иустин. В переводе с латыни оно означает «справедливый». Полное имя в старину звучало слишком торжественно для повседневной речи, поэтому в крестьянской и мещанской среде его сокращали и переделывали на свой лад. Так появились Устя, Устяха и, соответственно, Устяхины.

У имени Иустин три покровителя: мученики Иустин и Иустин Философ, которых поминают 14 июня, и преподобный Иустин с днём памяти 30 ноября. Философ Иустин — фигура для раннего христианства заметная: он соединял веру с античной учёностью и погиб за неё в Риме во II веке. Но на Руси эти житийные подробности мало что значили для простого человека — имя воспринимали как редкое, книжное, а потому легко перекраивали в привычное Устя.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Устяхина — это «дочь или жена Устяхи», а изначально, в мужском варианте Устяхин, — «сын Устяхи». Модель типична для русских фамилий, сложившихся из отчеств. Основатель рода, судя по форме имени, был человеком простого сословия — среди дворянства такие обиходные варианты не приживались, там держались за полное написание.

Интересно, что фамилия сохранила именно женскую форму в названии рода, хотя по правилам русской ономастики исходной всегда была мужская. Устяхины встречаются в центральных русских областях, но фамилия не частотная, что говорит о локальном происхождении — скорее всего, она закрепилась в одном или нескольких сёлах и оттуда распространилась.