Фамилия Уйсипхан — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели образования от славянских корней или тюркских прозвищ с суффиксами -ов/-ев. Скорее всего, перед нами сложное имя-оберег, которое в неизменном виде перешло в фамилию. Основа «хан» указывает на высокий статус или титул (правитель, князь), но в соединении с первой частью «уйсип» (или «уйсып») смысл меняется. Если предположить тюркское происхождение, «уй» может означать «дом» или «род», а «сып» — «отрезать», «прерывать». Вместе с «ханом» это могло значить «хан, прервавший род» или «хан, лишённый дома» — то есть имя-оберег, которое давали, чтобы отвести от ребёнка злые силы: мол, он на самом деле не знатный, а потому не вызовет зависти.

Вероятна и казахская или башкирская основа, где «уйсып» — диалектная форма глагола «уйысу» (застывать, цепенеть). Тогда Уйсипхан — «застывший хан», «неподвижный правитель». Такое прозвище мог получить человек медлительный, невозмутимый или же тот, кто в бою держался стойко, как каменный.

Фамилия не имеет русского суффикса — ни -ов, ни -ин, ни -ский. Это значит, что носители сохранили исходную форму имени, не русифицируя её. Встречается она преимущественно у казахов, реже у башкир и татар, в среде, где фамилии закреплялись поздно (вплоть до середины XX века) и часто оставались записью личного имени или прозвища. Сословной принадлежности по такой фамилии не определить: «хан» в имени не гарантирует знатного происхождения — в тюркской антропонимике этот титул часто входил в состав имён простолюдинов как пожелание силы или как часть оберега.

Из-за редкости фамилия почти не встречается в исторических документах дореволюционной России. В современных базах данных Уйсипхан фигурирует единично, в основном в Казахстане и среди татарской диаспоры. Сравните с однокоренными: Уйсыпов (с русификацией) или Уйсипханов (с добавлением -ов) — такие варианты встречаются чаще, но исходная форма без суффикса остаётся самой точной и архаичной.