Фамилия Ужусенис образована от прозвища Ужус. По одной из версий, оно восходит к литовскому глаголу užusti – «почуять». Исходя из этого, можно предположить, что Ужусом прозвали человека с развитым обонянием или интуицией. Согласно другой гипотезе, прозвище Ужус этимологически связано с литовским словом užusalè – «пазуха печи». В таком случае прозвище Ужус, скорее всего, относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог заниматься кладкой печей.