Фамилия Вачария — редкая и неочевидная для русского уха, и её разбор на привычные суффиксы-окончания вроде -ов или -ин не сработает. В ней нет типичного русского патронимического суффикса, что сразу подсказывает: перед нами не коренная великорусская фамилия, а скорее заимствованная или образованная по иной модели.

Вероятнее всего, основа фамилии — Вачар. Это может быть вариант имени или прозвища. Здесь возможны две основные версии происхождения, и обе имеют право на жизнь.

Первая — грузинская или мегрельская. В грузинском языке существует слово «вачари» (ვაჭარი), которое означает «купец», «торговец». Суффикс -ия (или -иа) в грузинских фамилиях — один из самых распространённых патронимических формантов (указывает на принадлежность к роду). Таким образом, Вачария могло означать «из рода купца» или «сын торговца». Фамилия могла принадлежать грузинскому или мегрельскому купеческому роду. Географически такие фамилии чаще встречаются в Западной Грузии (регион Самегрело).

Вторая версия — тюркская или кавказская (адыгская, абхазская). В некоторых тюркских языках есть корни со значением «кричать», «звать», «шуметь». В таком случае прозвище Вачар могли дать громогласному, активному человеку, зазывале на базаре или глашатаю. Эта версия слабее, так как суффикс -ия для тюркских фамилий нехарактерен, но в случае долгого бытования на Кавказе фамилия могла «обкататься» под местные модели.

Встречается фамилия и в форме Вачария у абхазских армян, что может говорить о смешанном происхождении или о том, что носители принесли её с собой из исторической Армении, где -ия — тоже распространённый фамильный суффикс.

В любом случае, этимология фамилии указывает на Кавказ как на родину предков. Носитель фамилии Вачария с высокой долей вероятности потомок либо грузинского купца, либо человека, получившего прозвище за голос или род занятий. Встречаемость фамилии в России крайне низкая, что делает её хорошим маркером конкретной семейной истории, уходящей корнями в Закавказье.