Фамилия Ваглай образована от аналогичного прозвища, которое, предположительно, этимологически связано со словом «вахлай», означающем «неповоротливый человек». Вероятно, основатель фамилии Ваглай отличался медлительностью, за что и получил свое прозвище. Не исключено, что фамилия Ваглай образована от аналогичного именования, которое, вероятно, восходит к средненемецкому слову vagl - «окунь». Таким образом, именование Ваглай могло указывать на профессию его носителя, например, он был рыбаком. Также возможна связь именование Ваглай с немецким словом Wagle (Wiege) - «колыбель», «люлька».