Фамилия Ваивар — редкий случай, когда основа не поддаётся однозначной славянской этимологии. В русском языке нет корня «ваив-», и суффикс -ар нетипичен для исконных русских фамилий: он встречается в украинских (бондарь, ткач) или в заимствованных польских и немецких моделях. Поэтому первая версия — географическая. Фамилия могла возникнуть в Прибалтике или Финляндии, где основа «Vaiva» (лит. «надежда») или эстонское «Vaivar» (название местности) дали прозвище, а затем и фамилию. В таком случае носитель — потомок выходца из этих регионов, который русифицировал окончание.

Вторая версия связана с профессиональным прозвищем. Суффикс -ар указывает на деятеля: в польском и украинском языках он образует названия ремёсел (кухар — повар, маляр — живописец). Если допустить, что «ваи» — искажённое «вай» (от нем. Waage — весы) или диалектное «вайть» (суетиться, хлопотать), то Ваивар мог быть весовщиком, менялой или торговцем, работавшим с весами. Однако эта гипотеза слабая: ни в одном из славянских языков нет слова «вай» в таком значении, и опираться на неё не стоит.

Третья, самая вероятная версия — фамилия искусственная, канцелярская. В XIX веке при переписи населения или выдаче паспортов чиновники нередко записывали фамилии на слух, искажая иноязычные прозвища. Ваивар могло получиться из литовского Vaišvila (от vaišės — угощение, пир) или из немецкого Weihwasser (святая вода), сокращённого до непривычного уху варианта. Запись «Ваивар» — это калька с произношения, а не осмысленное слово.

География фамилии тоже подсказывает её происхождение: Ваивары встречаются в основном на северо-западе России — в Ленинградской области, Карелии, а также в Эстонии. Это совпадает с зоной исторического влияния немецкой и прибалтийской администрации, где фамилии часто присваивались произвольно. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или мещанской — дворяне с такой фамилией в дореволюционных списках не значатся.

Таким образом, фамилия Ваивар — не славянская по корню, а западная или прибалтийская, адаптированная русским языком. Точное значение исходного слова утеряно, но по модели образования (суффикс -ар) можно предположить, что предок был либо ремесленником, либо человеком, получившим прозвище по месту жительства.