Фамилия Вакациенко — редкий случай, когда корень слова не славянский, а латинский, и попал он в украинскую фамилию через польское или немецкое посредничество. Основа — «вакация» (от лат. vacatio — «освобождение, досуг»), что в польском и западнорусском (староукраинском) языках означало «каникулы, отпуск, свободное время». В Речи Посполитой так называли период, когда учебные заведения или суды не работали.

Суффикс «-енко» — типичный украинский патронимический (указание на происхождение от отца или предка). В буквальном смысле Вакациенко — «сын того, кто связан с вакацией». Но что могло стоять за этим прозвищем? Есть две версии, и обе правдоподобны.

Первая: прозвище Вакация могли дать человеку, родившемуся в каникулярное время — летом, когда школы пустели. Вторая, более житейская: так могли прозвать ленивого или праздного человека, который «всегда на каникулах». В крестьянской среде, где работа была основой выживания, такое прозвище звучало бы иронично, но не обязательно обидно — скорее как шутливое указание на характер.

Фамилия явно оформилась на землях современной Центральной или Западной Украины, где было сильно польское влияние и где слово «вакація» вошло в местные говоры. В российских переписях эта фамилия встречается крайне редко, что подтверждает её локальное происхождение. В отличие от «каникулярных» фамилий на -ов (вроде Каникулова), форма на -енко говорит о том, что носитель принадлежал к казацкой или крестьянской среде, где патронимические фамилии были нормой, а не к шляхте, предпочитавшей фамилии на -ский.

Забавно, что носитель фамилии Вакациенко носит в себе корень, означающий «отдых», — при том, что в реальности его предки, скорее всего, были людьми труда, не знавшими длинных отпусков. Это как раз тот случай, когда фамилия могла быть дана «навыворот», с долей народной иронии.