Фамилия Ваксар образована от аналогичного прозвища, которое, предположительно, восходит к слову «вакса» - «средство для ухода за кожаной обувью». Вполне вероятно, что именование Ваксар в данном случае представляет собой вариант прозвища Ваксарь, которое получил человек, занимавшийся изготовлением или продажей ваксы или чисткой обуви. Не исключено, что такое прозвище Ваксар имеет еврейское происхождение и восходит к средненемецкому (или еврейскому) слову Wahs со значением «воск». В таком случае именование Ваксар мог получить торговец воском или продавец изделий из воска. Фамилия Ваксар образовалась при помощи суффикса -ар (-арь), который указывает на принадлежность к какой-либо профессии.