Фамилия Валионите — редкий для России случай, когда фамилия не просто заканчивается на суффикс, а сохраняет литовский грамматический род. Окончание -ите (-ytė) в литовском языке — типичный суффикс, образующий женские фамилии от мужских основ. Мужская версия той же фамилии звучала бы как Валионис. Это значит, что предок, от которого пошла фамилия, был мужчиной по фамилии Валионис, а его жена или дочь получила форму Валионите. Такая модель распространена в Литве и в пограничных с ней районах Беларуси и Польши, где жили или живут литовцы.

Корень фамилии — valia. В литовском языке valia означает «воля», «свобода», а также «желание». Исходное прозвище Валионис могло принадлежать человеку своенравному, свободолюбивому или, наоборот, тому, кто действовал по своей воле, не подчиняясь обстоятельствам. Встречается и другая версия: valia в диалектах могло относиться к имуществу или наследству, тогда прозвище давали хозяину, владельцу.

В России фамилия Валионите встречается редко и почти исключительно у женщин. Это связано с тем, что в советских паспортах литовские женские фамилии часто записывали в оригинальной форме, без русификации. Если мужчина Валионис мог получить окончание -ов или -ин, то женщина Валионите сохраняла окончание, указывающее на её пол. Сейчас носительницы фамилии живут в основном в Калининградской области и в Москве, куда переезжали из Литвы в советское и постсоветское время.

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна для русского уха: суффикс -ите здесь не уменьшительный и не патронимический, как в русском языке, а чисто грамматический, родовой. В русской среде такую фамилию часто склоняют с трудом или вовсе не склоняют, хотя по литовским правилам она склоняема.