Фамилия Валункова — женская форма фамилии Валунков. Её основа — не очевидный «валун» в значении «большой камень». В русских говорах слово «валун» имело и другое, более прозаическое значение: так называли неуклюжего, неповоротливого человека, увальня. Прозвище Валун могли дать крупному, медлительному мужчине, и от него пошла фамилия. В пользу этой версии говорит и типичная модель: суффикс -ов/-ев образует фамилии от прозвищ, а не от географических названий (камень-валун как объект редко становился основой для прозвища).

Однако есть и вторая, менее распространённая гипотеза. В некоторых диалектах «валун» — это вид овчины или валенок, свалянных из грубой шерсти. Тогда прозвище могло указывать на занятие: валяльщик шерсти или торговец валенками. Но эта версия слабее: слово в таком значении фиксируется редко и локально, а прозвище по физической черте (неповоротливость) встречается гораздо чаще.

Суффикс -ков в фамилии Валунков — вариант -ов после основ на -к (Валунко → Валунков). В украинской и белорусской традиции такие фамилии нередки, но в русской среде они тоже встречаются, особенно в южнорусских областях. География фамилии Валункова — преимущественно центральные и южные регионы России, где слово «валун» в значении «увалень» было в ходу.

Сословной привязки у фамилии нет: её носители могли быть и крестьянами, и мещанами. В документах XVIII–XIX веков Валунковы встречаются среди однодворцев (особый разряд государственных крестьян) в Тамбовской и Рязанской губерниях. Это косвенно подтверждает бытовое, а не книжное происхождение фамилии — однодворцы часто носили фамилии, образованные от прозвищ.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями: Валуев, Валутин, Валухов — все они восходят к той же основе «вал-» (медлительный, неуклюжий). Валункова стоит в этом ряду как форма с увеличительным суффиксом -ун, подчёркивающим яркую черту характера.