Фамилия Валужис — редкий гость в русском ономастиконе, и её происхождение напрямую связано с литовским или латышским языковым влиянием. Суффикс -ис характерен для литовских фамилий (аналогично латышскому -с, -ис), где он указывает на принадлежность или происхождение. В русской среде такие фамилии обычно появлялись у выходцев из Великого княжества Литовского или западных губерний Российской империи, где смешивались славянские и балтские элементы.

Основа фамилии — «валуж» — скорее всего, восходит к литовскому слову valgyti (есть, питаться) или valgis (еда, блюдо). В таком случае Валужис могло быть прозвищем человека, связанного с приготовлением пищи, либо того, кто отличался хорошим аппетитом. Менее вероятна связь с диалектным русским «валух» (кастрированный баран) или «валужить» (валять, мять), так как балтский суффикс -ис указывает на иную языковую среду.

Географически фамилия могла закрепиться на территории современной Литвы, Латвии или в приграничных районах Беларуси и Псковской области. В русских переписях XIX века встречается редко, чаще в метрических книгах католических приходов. Валужис — не переоформленная в русский лад фамилия (не стала Валузовым или Валужиным), что говорит о сохранении носителями своей идентичности или о поздней миграции.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает балтский след: Валужис стоит в одном ряду с литовскими Валгутис, Валгаускас, где корень тот же — «еда, кормление». Если предок был крестьянином или ремесленником, прозвище могло закрепиться за тем, кто работал поваром или кормильцем в общине. В дворянских гербовниках фамилия не зафиксирована, что указывает на её простонародное, скорее всего, крестьянское или мещанское происхождение.

Точной даты появления фамилии назвать нельзя, но по модели образования она могла сложиться в XVI–XVII веках, когда в Великом княжестве Литовском активно формировались наследственные прозвища. Сегодня Валужис — редкая фамилия, встречающаяся в Литве, Латвии и у потомков эмигрантов в США и Канаде.