Фамилия Ванюткина — женская форма фамилии Ванюткин, а та, в свою очередь, образована от имени Ванютка. Здесь мы видим редкий случай, когда в основе лежит не крестильное имя Иван (как в Ванькове или Ванине), а его ласкательно-уничижительная форма с суффиксом -утк-. Такие суффиксы (-утк-, -ютк-) в русских говорах придавали имени оттенок фамильярности или жалости: «Ванютка» — это не просто Ваня, а скорее «Ванюшка», но в грубоватом, простонародном ключе. Подобные формы встречались в северных и центральных губерниях, где любили уменьшительные прозвища с неожиданными суффиксами.

Типичная русская модель: отчество от прозвища или неканонического имени. Если у человека было уличное имя Ванютка (а не полное Иван), то его дети становились Ванюткиными. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Ванюткин. В официальных документах XVIII–XIX веков такие фамилии часто закреплялись за крестьянами и мещанами, у которых не было родовых прозваний, а отчество превращалось в наследственную фамилию.

Географически фамилия Ванюткина (и Ванюткин) встречается в основном в центральной России, особенно в Тверской, Ярославской и Московской областях. Встречается и на Урале, куда переселенцы принесли её в XVII–XVIII веках. Интересно, что в некоторых диалектах слово «ванютка» могло означать не только имя, но и прозвище неряшливого или вялого человека, хотя это менее вероятно: основная масса фамилий всё же восходит к личным именам.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Ванюков, Ванюшин, Ваньков — то Ванюткин стоит особняком из-за редкости суффикса. Ванюков образован от Ванюк (украинское или южнорусское влияние), Ванюшин — от Ванюша, а Ванюткин — от более специфичной формы. В документах XIX века встречаются варианты написания: Ванюткин и Ванюткина (женская форма), но без буквы «ё» — это важно, так как произношение могло быть с ударением на первый или второй слог. Точных данных о дворянском происхождении нет — фамилия почти наверняка крестьянская или мещанская, что не делает её менее интересной с точки зрения истории быта.