Фамилия Варгушенкова — одна из тех русских фамилий, чья история лежит на стыке личного имени и прозвища, а её разбор требует внимания к суффиксальному аппарату. В основе почти наверняка лежит имя или прозвище Варгуша. Это уменьшительная форма от канонического имени Варлаам (в просторечии Варлам) либо от Варфоломей. В русской народной среде такие имена дробились на множество обиходных вариантов: Варя, Вара, Варка, а Варгуша — один из них, с характерным суффиксальным оформлением, указывающим на ласкательное или уменьшительное отношение. Впрочем, не исключено, что Варгуша могло быть прозвищем, образованным от диалектного глагола «варганить» — делать что-то небрежно, на скорую руку, или от «варга» (рот, горло), что давало прозвище крикливому человеку. Но первая версия — от имени — выглядит более убедительной, так как суффикс -уш- типичен именно для русских уменьшительных личных имён (Петруша, Ванюша, Варгуша).

Словообразовательная модель проста и показательна: Варгуша → Варгушенков → Варгушенкова. Суффикс -енков (вместо более распространённого -ов) указывает на географическое происхождение. Такая форма типична для фамилий, возникших в южнорусских и западнорусских регионах, особенно на территории современной Украины, Белгородской, Курской, Воронежской областей. В центральной и северной России чаще встречались бы варианты Варгушин или Варгушев. Суффикс -енков буквально означает «маленький, сын Варгуши», то есть фамилия — это отчество второго порядка, закрепившееся за потомками человека по имени Варгуша.

Фамилия Варгушенкова — женская форма, образованная по стандартному правилу русского языка от мужской Варгушенков. Это указывает на то, что родоначальник семьи был мужчиной, которого в документах записали как Варгушенков, а его жена или дочь — Варгушенкова. В дореволюционной России такие фамилии редко фиксировались у крестьян, чаще — у однодворцев или мещан южных губерний, где суффикс -енков был особенно распространён.

С точки зрения социального контекста, фамилия Варгушенкова не дворянская и не купеческая. Её носители, скорее всего, происходили из крестьянской или казачьей среды. Варлаам и Варфоломей — имена церковные, популярные в простонародье, так что ничего аристократического в основе нет. Спорных версий здесь немного: иногда пытаются связать корень с финно-угорскими языками (в коми «варг» — ворона), но это натяжка — суффикс -уш- и -енков однозначно выдают славянскую, русскую природу фамилии. Никаких известных исторических личностей с такой фамилией не зафиксировано, что типично для массовых крестьянских фамилий, которые не попали в родословные книги.