Фамилия «Ваыавы» нестандартна для русского языка. В ней нет привычных суффиксов (-ов, -ин, -ский), которые указывают на принадлежность роду или месту. Скорее всего, это фамилия нерусского происхождения, записанная кириллицей. Основная гипотеза — она могла возникнуть у народов Кавказа, например, у аварцев или лезгин, где распространены фамилии с повторяющимся слогом «ва» и окончанием на гласную. В аварском языке «ва» — часть имен или слов, обозначающих родство или принадлежность к тухуму (роду). В этом случае «Ваыавы» может быть искаженной при переписи формой исходной фамилии, например, Вагабов или Вахаев, где при записи от руки буквы «г», «х» или «ь» прочитали как «ы», а окончание «-ов» сократилось.

Другая, менее вероятная версия — искусственное происхождение. В советское время при паспортизации в отдаленных регионах (например, в Сибири или на Дальнем Востоке) работники загсов могли записывать фамилии на слух, не вникая в этимологию. Если предок назвал себя прозвищем, которое на местном наречии звучало как «Ваыава» (возможно, от слова, означающего «чужак» или «гость»), то паспортист записал его буквально, без поправок на русскую грамматику. Такие случаи редки, но они объясняют появление фамилий с нехарактерным для русского языка чередованием гласных.

Если отталкиваться от звучания, «Ваыавы» напоминает попытку передать имя или прозвище с гортанными звуками, которых нет в русском языке. В тюркских языках, например, «ва» может быть частью слова «вай» (горе) или «вах» (восклицание), а повторение слога часто указывает на уменьшительно-ласкательную форму. Но строить на этом прочную версию сложно: фамилия слишком короткая и не имеет подтверждённых аналогов в известных ономастических словарях.

Географически фамилия «Ваыавы» почти не встречается в центральной России. Единичные носители зафиксированы в Дагестане и Чечне, что подтверждает кавказскую гипотезу. В таких фамилиях суффикс не нужен — родовая принадлежность передаётся через корень, а окончание на «ы» могло появиться из-за того, что в русском языке фамилию «Ваыава» склоняли по мужскому роду, добавив окончание «-ы» (как «отец Ваыавы»). Со временем эта форма закрепилась в документах и стала восприниматься как исходная.

Единственное, что можно сказать с уверенностью: фамилия «Ваыавы» не славянская и не была образована от имени или прозвища по русской модели. Её носители — потомки людей, чей язык и культура отличались от русской, а сама фамилия — документ, зафиксировавший звучание, которое было трудно передать кириллицей.