Фамилия Вайбузов — редкий случай, когда корень не поддаётся однозначной славянской этимологии. При первом взгляде на неё напрашивается связь с тюркскими языками. Основа «Вайбуз» или «Вайбус» может восходить к тюркскому личному имени или прозвищу. В тюркских языках «вай» (или «бай») часто означает «богатый», «господин», а вторая часть — «буз» — может быть искажённым «буз» (лёд, холод) или «боз» (серый, седой). Однако более вероятно, что мы имеем дело с вариантом фамилии, образованной от мужского имени Вайбулат или Бабулат, где «булат» (сталь) со временем редуцировалось до «буз». Такое фонетическое сжатие — обычное дело в живой речи.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую модель образования фамилий: «чей?» — Вайбузов, то есть сын или потомок Вайбуза. Это говорит о том, что фамилия, скорее всего, оформилась уже в русскоязычной среде, возможно, среди крещёных татар, башкир или представителей других тюркских народов, которые вошли в состав Российского государства. Носители фамилии могли быть выходцами из Поволжья, Приуралья или южнорусских степей, где тюркские и славянские фамилии активно смешивались.

Менее правдоподобная, но допустимая версия — связь с топонимом. В некоторых регионах (например, в Башкортостане) есть населённые пункты с похожими названиями, вроде Вайбулатово. Если предок получил прозвище по месту жительства, фамилия могла закрепиться в форме Вайбузов. Но без письменных источников XVII–XVIII века утверждать это сложно.

В русском языке фамилия звучит нехарактерно, что сразу выдаёт её иноязычное происхождение. Несмотря на редкость, она не уникальна — встречается в единичных записях, в основном на юге Урала и в Западной Сибири. Социальный статус первых носителей, скорее всего, был крестьянским или казачьим: тюркские основы в фамилиях такого типа обычно указывают на рядовых общинников, а не на дворянство.