Фамилия Вайштарас — редкий пример, когда происхождение почти наверняка литовское, а не славянское. В русском контексте фамилии с таким финальным -ас встречаются нечасто, и это сразу указывает на балтский языковой след.

Скорее всего, в основе фамилии лежит литовское слово vaistas — «лекарство» или «средство». Тогда прозвище Вайштарас мог получить деревенский лекарь, знахарь или аптекарь. В литовской ономастике прозвища от названий профессий — обычное дело, и эта версия выглядит самой прямой и правдоподобной.

Есть и вторая, более сложная гипотеза. Она собирает прозвище из двух слов: vaišus — «гостеприимный, радушный» и tarėjas — «хозяин». В таком случае Вайштарас — это «гостеприимный хозяин», человек, который славился широтой души и умением принять гостей. Эта версия менее очевидна, потому что требует склейки двух разных корней, что для прозвища нехарактерно, но полностью исключать её нельзя.

Суффиксальная модель в этой фамилии не русская (-ов/-ев или -ин), а литовская. Окончание -ас — характерный признак мужского рода в литовском языке, и фамилия не адаптировалась под русское склонение. Это говорит о том, что носители фамилии, вероятно, долгое время жили в балтоязычной среде — на территории современной Литвы или в пограничных районах Беларуси и Польши, где исторически были сильны литовские говоры.