Фамилия Вайтекус является литовским или латышским вариантом польской фамилии Вайтек (Войтек). По одной из версий, она образована от имени Войтек, которое является диалектным вариантом польско-чешского имени Войтех (Войцех), что переводится на русский язык как «тот, кто приносит утешение и силу войску». Согласно другой версии, фамилия Войтек образована от прозвища Войт.