Фамилия Велахунова — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве основной, а мужская (Велахунов) почти не встречается. Такая модель, с окончанием -а, типична для южнорусских и украинских говоров, где фамилии на -ов/-ев нередко употребляются в женском роде как неизменяемые. Но здесь мы имеем дело не с диалектной особенностью, а с фиксацией именно женской формы, что намекает: предок по мужской линии либо не оставил потомков с фамилией в мужском роде, либо в документах записали вдову или дочь.

Основа фамилии — прозвище Велаху́н. Корень «велах-» не имеет прямых аналогов в русском литературном языке, но в диалектах юга России и Украины слово «велах» могло означать «великан», «рослый человек» или, напротив, «неуклюжий, мешковатый». Сравните с украинским «велетень» (великан) и диалектным «вела́ха» — так в некоторых областях называли высокого, нескладного парня. Суффикс -ун в прозвищах указывает на деятеля или носителя признака: «велаху́н» — тот, кто отличается ростом или неуклюжестью. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, получил прозвище за внешность — был заметно выше среднего или двигался неловко.

Географически фамилия тяготеет к Ростовской области и Краснодарскому краю, реже встречается в центральных регионах. Это не случайно: именно на южных окраинах России, где смешивались русские, украинские и казачьи говоры, активно образовывались фамилии с диалектной основой. В архивных записях XIX века Велахуновы числятся среди государственных крестьян и казаков, что подтверждает народное происхождение фамилии — без дворянских корней.

Интересно, что фамилия не попала в основные ономастические словари (Унбегауна, Никонова), что говорит о её локальном бытовании. Носители фамилии сегодня нередко сталкиваются с искажениями при записи: путают с «Велаховой» или «Велаховой». Но именно окончание -унова выдаёт прозвищную природу, а не патронимическую (от имени). Прозвища на -ун (крикун, молчун, бегун) в русской ономастике всегда указывали на характерное качество, и Велахунов здесь не исключение — перед нами фамилия-портрет, за которой стоит конкретный человек, выделявшийся среди односельчан ростом или статью.