Фамилия Вилциенс — редкий для России случай, когда латышская модель фамилии сохранила свою форму без обрусения. В отличие от привычных русских фамилий на -ов, -ин или -ский, окончание -енс (латыш. -ens) выдаёт в носителе потомка латышского крестьянина или горожанина из Курземе, Видземе или Латгалии. Это типичный суффикс латышских фамилий, образованных от имён, прозвищ или названий профессий, который в XIX веке закрепился в ходе массового присвоения фамилий латышскому населению.

Основа Вилци- восходит к латышскому слову vilks — «волк». В латышской ономастике фамилии с корнем Vilc- (Vilks, Vilciņš, Vilcāns) встречаются повсеместно, и Вилциенс — один из вариантов, где суффикс -ien-/-ēn- указывает на принадлежность или происхождение: «сын Волка» или «человек из рода Волка». Прозвище Волк у латышей, как и у многих народов, могло даваться за хитрость, одиночество, свирепый нрав или внешнее сходство с хищником.

Интересно, что фамилия Вилциенс могла возникнуть и от топонима: в Латвии есть несколько хуторов и мест с названием Vilciņi, Vilcēni. В таком случае фамилия означала бы «выходец из Вилциенов» — типичная практика для латышских фамилий, где суффикс -en-/-ien- часто служил указателем на место жительства.

В России фамилия Вилциенс встречается единично, преимущественно среди потомков латышских переселенцев, которые в конце XIX — начале XX века переезжали в Сибирь и на Дальний Восток по столыпинской аграрной реформе. Носители фамилии могли быть крестьянами или мелкими ремесленниками, но сословная принадлежность здесь не определяется однозначно — латышские фамилии на -енс не делили на дворянские и крестьянские, как в русской традиции.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Вилциенс стоит в одном ряду с латышскими Вилкс и Вилциньш, но отличается от них именно суффиксом, который в латышском языке придаёт оттенок «происходящий от» или «принадлежащий». В польской и белорусской традиции похожий корень дал бы фамилии Вилковский или Вильчинский — но Вилциенс остаётся чисто латышским вариантом, не адаптированным к русской грамматике.