Фамилия Вилячинский — характерный пример польской или западнорусской модели образования с суффиксом -ский. Такие фамилии указывали на принадлежность к месту или на прозвище, связанное с каким-либо объектом, и часто встречались у шляхты, духовенства или мещан в Речи Посполитой и на землях, вошедших в состав Российской империи после разделов Польши.

Скорее всего, фамилия происходит от названия населённого пункта — Вилячино (или Вилячин). Такие топонимы могли возникнуть от личного имени или прозвища Виляк, Виляч, которые, в свою очередь, связаны с польским словом wilk — «волк». В ономастике распространена модель, когда житель деревни Вилячино получал фамилию Вилячинский, то есть «тот, кто из Вилячина». Похожие фамилии — Виляковский, Вилянский — подтверждают эту словообразовательную цепочку.

Менее вероятна, но возможна версия, что основа происходит от диалектного глагола «вилять» — в значении «хитрить, уклоняться». В этом случае прозвище Виляка или Виляч могло закрепиться за человеком с изворотливым характером, а потом перешло в фамилию через тот же суффикс -инский. Однако польская огласовка (с мягким «ч») склоняет к первой, топонимической, версии.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам современной Беларуси и восточной Польше — областям, где смешивались польская и восточнославянская традиции. В дореволюционных метриках Вилячинские могли записываться как мещане или крестьяне, но сам суффикс -ский в этой среде часто указывал на более высокий социальный статус предка, чем у крепостных крестьян с фамилиями на -ов/-ев.

Написание фамилии устойчиво: Вилячинский, с ударением на втором слоге. Встречающиеся варианты Вилячински (полонизированная форма) или Вилячинской (старая орфография) редки и не меняют корня.