Фамилия Винивитина — один из тех случаев, когда ухо слышит что-то не вполне русское, а на поверку оказывается, что корни чисто славянские, просто слово со временем исказилось. Если разобрать её по косточкам, то основа — «винивит» — это диалектная или искажённая форма прилагательного «виноватый». В северных и сибирских говорах, где «а» после мягких согласных часто переходило в «и», слово «виноватый» могли произносить как «винивитый». Соответственно, прозвище Винивитый получал человек, которого считали виноватым, провинившимся, или, возможно, тот, кто постоянно извинялся, ходил с виноватым видом. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Винивитина, то есть жена или дочь Винивитого. Таким образом, фамилия метила не столько в характер, сколько в конкретную ситуацию — закрепилась за потомками человека, однажды крепко провинившегося.

Модель образования типична для русских фамилий на -ин, которые пошли от прозвищ и имён на -а/-я. Но есть и альтернативная, менее вероятная версия: некоторые исследователи связывают основу с устаревшим словом «винити» — обвинять, укорять. Тогда Винивита мог быть не виноватым, а обвинителем, человеком, который любил указывать на чужие ошибки. Однако эта гипотеза слабее: прозвища в форме страдательного причастия («виноватый») встречаются в ономастике гораздо чаще, чем названия действующего лица с таким редким суффиксом.

Фамилия редкая и географически привязана к Русскому Северу и Сибири. Встречается в Вологодской, Архангельской областях и в Забайкалье — там, где староверы и переселенцы сохраняли архаичные формы речи. В XIX веке носители фамилии числились в основном среди государственных крестьян, реже — в мещанском сословии. Никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано: это стопроцентно крестьянское прозвище, которое стало наследственным.

Уникальная деталь: написание «Винивитина» вместо ожидаемого «Виновитина» — прямое фонетическое свидетельство того, как «оканье» на севере сменялось «иканьем» под влиянием местных говоров. Если бы фамилия закрепилась в Москве или на юге, она, скорее всего, писалась бы через «о» — Виновитин. А тут мы видим живую запись того, как слово прозвучало в момент фиксации в метрической книге.