Фамилия Вишейко — редкий пример восточнославянской фамилии, образованной не от нарицательного слова, а от уменьшительно-ласкательной формы личного имени или прозвища. Её основа — «Виш-» — скорее всего, восходит к имени Виша (Виш), которое в древнерусском языке было сокращённой формой от полного крестильного имени Виссарион (в просторечии — Виссарионович, Виссарионов). В белорусской и украинской ономастике такой способ усечения корня с добавлением суффикса -ейк- (-ейко) был типичен: так образовывали фамилии от имён (Яшейко от Яков, Матвейко от Матвей) или от прозвищ (Белейко, Червонейко). Суффикс -ейк- в белорусской традиции придавал фамилии «патронимический» оттенок, указывая на потомка человека по имени Виша.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с глаголом «вишать» (в диалектах — «вешать, висеть») или прозвищем Виш (от «виш» — крик, визг, или от «вишня»). Однако в таком случае ожидалась бы фамилия с суффиксом -енко (Вишенко) или -ев (Вишев), а не с -ейко. Кроме того, в белорусских говорах слово «виша» фиксировалось как «верхушка, макушка», что могло стать прозвищем высокого или сутулого человека, но это лишь гипотеза.

Географически фамилия Вишейко почти не встречается за пределами Беларуси и западных областей России (Смоленщина, Брянщина). В дореволюционных метрических книгах Могилёвской и Витебской губерний попадаются записи о крестьянах и мещанах с такой фамилией. Дворянских родов Вишейко не известно — это типичная крестьянско-мещанская фамилия, распространённая в среде православных и униатов.

Поскольку основа неясна, а суффикс однозначно указывает на белорусское происхождение, наиболее правдоподобно считать, что предки носителей фамилии — выходцы из центральной или восточной Беларуси, потомки человека по имени или прозвищу Виша. Другие версии (от «вишня» или «висеть») слабее, так как не объясняют суффиксальной модели.