Фамилия Витищенко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках была распространена в Поднепровье, на Слобожанщине и юге России. Суффикс -енко изначально имел значение «сын» или «потомок», поэтому Витищенко — это буквально «сын Витища». Основа здесь нестандартная: если большинство фамилий на -енко образованы от личных имён (Иващенко, Петренко), то в данном случае в корне лежит прозвище или название по месту жительства.

Разберём корень «Вит-». Он может восходить к древнерусскому слову «вить» — в значении «извилина», «поворот» или «плетение». Прозвище Витищ могли дать человеку извилистого, хитрого нрава, либо тому, кто жил у речной излучины или на перекрёстке дорог. Другая, более правдоподобная версия — основа от глагола «вить» в значении ремесла: витищем называли мастера, который вил верёвки, канаты или плёл корзины. В украинских говорах слово «витися» означало «извиваться», что также могло отражать характер или род занятий.

Менее вероятно, но не исключено, что Витищенко — это «украинизированная» форма от русского Витищев или Витин. В таком случае основа могла быть краткой формой имени Вит (от Виталий или Виктор), но суффикс -ищ указывает скорее на прозвищное происхождение, чем на уменьшительное имя. В ономастических словарях эта фамилия не частотна, что говорит о её локальном бытовании — скорее всего, в Черниговской или Полтавской губерниях, где фамилии на -енко особенно типичны.

Фамилия Витищенко не относится к дворянским или казачьим старшинам — по суффиксу и корню она крестьянская или мещанская. Носители фамилии, вероятно, были ремесленниками, связанными с плетением, или жителями села с характерным названием Витищево (такие топонимы встречаются на Украине и в Беларуси). Встречается также вариант Витищенко с ударением на второй слог, что указывает на южнорусское или украинское произношение.