Фамилия Витценко — редкий пример того, как украинский суффикс -енко прирастает к основе, которая звучит совершенно не по-славянски. Если сразу снять патронимический суффикс (а -енко как раз указывает на «сына» или «потомка»), остаётся корень Витц-. Он явно западного происхождения, и в украинских фамилиях такое сочетание встречается нечасто.

Скорее всего, в основе лежит немецкая или еврейская фамилия Витц (Witz) — в немецком языке это слово означает «острота, шутка, остроумие». В таком случае Витценко — это украинизированная форма: переселенца или мастера из немецких колоний записали на украинский лад, добавив типичный для Левобережья или Слобожанщины суффик. Другая версия, менее вероятная, но допустимая — связь с польским или белорусским прозвищем Витц, которое могло означать «витой, извилистый» (от слова «вить»), но тогда логичнее было бы ожидать форму Витченко или Витенко.

В пользу немецкого корня говорит и сама структура: фамилии на -енко от иноязычных основ часто возникали в среде ремесленников или колонистов, которых приглашали на украинские земли в XVIII–XIX веках. Если предок был, скажем, часовщиком или аптекарем с фамилией Витц, его дети уже записывались как Витценко. Географически фамилия встречается в основном в центральной и восточной Украине, а также в прилегающих областях России — это типичный ареал расселения немецких колонистов, переходивших на украинскую антропонимию.

В написании обращает на себя внимание двойной согласный «тц» — он редок для восточнославянских фамилий и обычно указывает на то, что исходная форма была заимствована без адаптации. Витценко — не переосмысленная русская фамилия, а именно гибрид: чужое имя, обрубленное местным суффиксом.