Фамилия Вонитовый — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает исходное слово. На слух она воспринимается как образованная от корня «вонь» (запах), но это ложный след. В русских фамилиях суффикс -ов- обычно присоединяется к основе, оканчивающейся на согласный: Петров, Иванов. Здесь же мы видим -итовый, что для фамилий нехарактерно. Скорее всего, перед нами не русская, а украинская или белорусская модель: фамилия на -овитый/-евитый. В украинском языке суффикс -овитий имеет значение обладания признаком в высокой степени, часто с оттенком пренебрежения или усиления. Например, «вонючий» — это просто пахнущий, а «вонючитий» — очень вонючий, зловонный. Соответственно, Вонитовый — это русифицированная форма украинской фамилии Вонючитий или Вонитовий.

Если отбросить суффикс, основа — «вонь» в значении «запах». Но не торопитесь с выводами. В древнерусском языке слово «воня» означало не только дурной запах, но и «запах» вообще, а также «дух», «дыхание», «благоухание». В церковнославянском «воня» — это аромат, благовоние. Поэтому прозвище Воня или Вонючий могло относиться не к нечистоплотному человеку, а, наоборот, к тому, кто пользовался душистыми мазями или торговал благовониями. В украинских говорах «воня» могло также означать «табак» или «нюхательный табак» — отсюда прозвище для любителя нюхать табак или торговца им.

Таким образом, фамилия Вонитовый могла возникнуть в украинской или белорусской среде, где суффикс -овитый был продуктивен. Её носитель — потомок человека, которого прозвали Вонючим, Вонею или Вонякой — не обязательно за неприятный запах, а, возможно, за профессию (парфюмер, табачник) или за манеру поведения (крикун, «вонючий» в переносном смысле — сварливый). Географически фамилия тяготеет к юго-западным областям бывшей Российской империи: современная Украина, Беларусь, юг России. При переписях и паспортизации XIX века украинская фамилия на -ий могла быть записана как Вонитовый (по аналогии с русскими фамилиями на -ов). Это объясняет, почему окончание выглядит не по-русски, а основа неочевидна.