Фамилия Воожанинов — редкий случай, когда географическая основа спрятана не в суффиксе, а в корне, да ещё и с историческим чередованием гласных. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не «воож», а «вож»: перед нами вариант фамилии Вожанинов, где двойное «оо» — следствие старого аканья или диалектного произношения, закреплённого на письме. Такое написание встречается в документах XVII–XVIII веков, когда фамилии ещё не устоялись, и писарь фиксировал звучание на слух.

Основа фамилии — прозвище или именование Вожанин, то есть «житель Вожи» или «выходец с Вожи». Вож — это река в Рязанской области, приток Оки, известная по Куликовской битве: в 1378 году на ней русские войска разбили татар. Но рек с названием Вож и Вожа в России несколько, и все они тяготеют к центральным и северным областям. Возможно, предок носителя фамилии жил на одной из таких рек или получил прозвище по месту жительства.

Модель образования типична для северных и центральных губерний: суффикс -ин указывает на принадлежность к роду Вожаниных. То есть Воожанинов — это «сын Вожанина». Двойное «о» не меняет смысла, но делает фамилию более редкой и узнаваемой. Встречается она в основном в Рязанской и соседних областях, что подтверждает речную версию.

Версия о происхождении от слова «вож» (предводитель) или «вожатый» маловероятна: в таком случае фамилия выглядела бы как Вожев или Вожаев, а не Вожанинов. Суффикс -анин устойчиво указывает на местность, а не на профессию или качество. Так что с большой долей уверенности можно говорить: Воожаниновы — потомки людей с реки Вожи, чья фамилия сохранила в себе и звук, и историю малой родины.