Фамилия Вовианко — редкий случай, когда основа почти наверняка не русская, а суффикс — украинский. Разберём по порядку.

Первое, что бросается в глаза, — окончание -ко. В украинской ономастике это один из самых распространённых фамильных суффиксов, указывающий на происхождение с территории современной Украины или юга России. Вовианко образован по той же модели, что и многие украинские фамилии: основа + -анк(о). Суффикс -анк-/-янк- (как в Степанко, Грицанко) часто прикреплялся к именам или прозвищам и означал «маленький», «сын такого-то» или просто нёс уменьшительно-ласкательный оттенок.

Корень «Вов-» почти наверняка восходит к украинскому слову «вовк» — волк. В украинском языке, в отличие от русского, в этой основе сохранилось чередование: вовк — вовчий. Отсюда и форма Вовк, и её производные: Вовченко, Вовчук, Вовкович, а также Вовянко (через суффикс -ян-). Написание через «и» — Вовианко — может быть результатом адаптации на письме: в украинском языке после шипящих и губных в конце основы мог писаться «і», а на русской почве его заменили на «и». Либо это диалектный вариант произношения.

Таким образом, наиболее вероятное толкование: Вовианко — украинская фамилия, означающая «сын Вовка» или «маленький волк». Предок носителя получил прозвище Вовк (Волк) — возможно, за внешнее сходство, характер или род занятий (охотник, живущий в лесу). Сама фамилия закрепилась в форме Вовянко, а в документах или при переезде в русскоязычную среду могла превратиться в Вовианко.

Менее вероятная, но возможная версия: основа от личного имени Вова (Владимир) с тем же суффиксом -янк-. Тогда Вовианко — «маленький Вова», «Вовик». Однако для украинской традиции производные от Вовк гораздо типичнее, чем от краткой формы Владимира: фамилии вроде Вовк, Вовченко встречаются в сотни раз чаще, чем Вовянко от имени.

Географически фамилия тяготеет к западным и центральным областям Украины, где суффикс -анк(о) особенно распространён, а также к регионам, откуда шла миграция украинцев в Россию (Кубань, Слобожанщина). Точных данных о сословной принадлежности нет, но массовый характер таких фамилий говорит о крестьянском или казачьем происхождении.