Фамилия Воюнков — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с военным делом, но не с высоким чином, а с бытовой стороной службы. Корень «воюн» в старых говорах означал не просто воина, а человека, который постоянно воюет, склонного к дракам, задиристого. В словаре Владимира Даля «воюн» — это и воин, и забияка, и даже «охотник до войны». Скорее всего, прозвище Воюн дали либо беспокойному соседу, которого все опасались, либо, наоборот, служилому человеку, который провёл жизнь в походах и стычках.

Модель образования типична для центральной России: суффикс -ов указывает на принадлежность — «сын Воюна». Фамилия Воюнков, таким образом, означает «потомок Воюна». В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образовывали от имён на -а/-я (Воюнин), форма на -ов закрепилась за прозвищами с твёрдой основой. Воюнков — это не искажение более известной фамилии, а самостоятельное образование, которое встречается гораздо реже однокоренных Воюнов и Воютин.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским областям, где слово «воюн» сохранялось в диалектах дольше. В дореволюционных переписях Воюнковы фиксировались среди крестьян и однодворцев — потомков служилых людей, нёсших сторожевую службу на границах. Это объясняет прозвище: предок мог получить его за боевой нрав или за то, что постоянно находился «на войне», то есть на пограничной службе.

Словообразовательный нюанс: в фамилии нет суффикса -к-, который иногда добавляют для уменьшительности. Воюнков — это Воюн + ов, а не Воюнок + ов. Форма «Воюнок» (с уменьшительным -ок) могла бы означать «маленький воин» или «сын Воюна», но в реальности закрепился полный вариант прозвища. Это отличает фамилию от таких, как Козлов или Петров, где основа ясна сразу — здесь требуется понимание диалектного оттенка слова.

Сегодня фамилия редкая, её носители разбросаны, но сохраняют связь с историческими территориями расселения. Если вы Воюнков, то ваш предок, скорее всего, был человеком с характером — либо профессиональным военным, либо тем, кого в деревне побаивались за неуживчивость. Обе версии правдоподобны и не противоречат друг другу.