Фамилия Вожаченко — яркий пример украинской модели фамилий, образованных при помощи суффикса -енко. Этот суффикс, буквально означавший «маленький» или «сын», был распространён в Поднепровье, Слобожанщине и на юге России, превращая любое прозвище или имя в наследственное родовое имя. Вожаченко — это не «чей-то сын», а скорее «сын Вожаки» или «потомок Вожака».

Корень фамилии — «вожак». В старину так называли предводителя, проводника, того, кто ведёт за собой. Вожаками могли быть и руководители ватаг (например, бурлацких или чумацких), и опытные охотники, знающие лесные тропы, и даже военные предводители небольших отрядов. Прозвище Вожак было не столько должностью, сколько характеристикой человека — смелого, инициативного, умеющего вести людей.

В отличие от более распространённых фамилий на -енко (например, Иващенко, Петренко), Вожаченко образована не от канонического имени, а от прозвища. Это делает её более редкой и социально окрашенной: носитель такой фамилии, скорее всего, потомок не крестьянина-земледельца, а человека, выделявшегося лидерскими качествами. Встречается она в основном в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев на Кубани и в Ставрополье.

Словообразовательная цепочка здесь проста: основа «вожак» → притяжательное прилагательное «Вожачен» (с чередованием к/ч) → суффикс -ко (в украинском языке он дал -енко). Таким образом, Вожаченко — это «тот, кто из рода Вожака». Фамилия не имеет отношения к глаголу «вожать» (водить) в его современном бытовом смысле — она целиком держится на старом прозвищном значении.