Фамилия Впекрук — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает произношение и происхождение. Скорее всего, перед нами искажённая запись фамилии Впекрук, где начальное «в» — это бывший предлог или приставка, сросшаяся с основой. В русских фамилиях такая модель встречается: например, Вползнев или Вторушин. Но здесь основа — не русская, а, вероятно, украинская или белорусская.

Если отбросить начальное «в-», остаётся корень «пекрук». Он явно восходит к украинскому «пекти» — печь, и «рук» — рука. Получается прозвище Пекарук или Пекрук: «тот, кто печёт руками» или «пекарь с руками». В украинских говорах слово «пекрук» могло означать человека, который постоянно возится у печи, пекаря, или, в переносном смысле, неумеху, который всё делает «как пек рукой» — неловко. Вторая версия менее вероятна, но возможна.

Фамилия могла возникнуть в западных регионах Украины или Беларуси, где диалекты сохраняют такие словообразовательные модели. Человек с прозвищем Пекрук, вероятно, был пекарем или владельцем пекарни. Со временем, при переезде в центральную Россию или при паспортизации, фамилию могли записать «на слух» — как Впекрук, приняв начальное «в» за часть фамилии, а не за предлог. Встречаются и варианты Впекарук, Пекарук, но Впекрук — наиболее редкая и искажённая форма.

Носители фамилии Впекрук — это, скорее всего, потомки украинских или белорусских переселенцев, чья фамилия претерпела графическую трансформацию при записи в русских документах. Найти однозначное упоминание в ономастических словарях сложно из-за редкости, но анализ корня и модели указывает именно на пекарское ремесло предка.