Фамилия Вувуникян при первом взгляде кажется нетипичной для русского уха, и это верное ощущение: перед нами яркий представитель армянской ономастики. Её выдает характерный суффикс -ян, который в армянском языке выполняет ту же роль, что русские -ов или -ин, — указывает на принадлежность, происхождение, буквально «из рода такого-то». В диаспорах и при русификации фамилий иногда встречается усеченный вариант Вувуникянц, где -янц — более старая форма того же суффикса, указывающая на «сына» или «потомка».

Основа фамилии — Вувуник. Скорее всего, это личное прозвище или уменьшительно-ласкательная форма от какого-то имени. В армянском языке есть корень «вув» (вув — звукоподражание, иногда связанное с криком совы или филина, а также с детским лепетом). Однако более вероятно, что Вувуник — это вариант имени Вовник или Вуник, которое, в свою очередь, восходит к армянскому имени Вов (Вовсеп, Вовхан — армянские формы от Иосифа или Иоанна). Суффикс -ик в армянском — один из самых распространенных уменьшительно-ласкательных (как русское -к- в «Ванька» или «Петька»). Таким образом, Вувуник могло означать «маленький Вов» или «Вовик».

Встречается и другая версия: прозвище могли дать по роду занятий. В некоторых диалектах армянского языка «вув» или «вуву» — подражание звуку трубы или рожка. Соответственно, Вувуник — человек, который дудит в рожок, пастух или музыкант, игравший на духовом инструменте. Эта версия менее распространена, но имеет право на существование, так как прозвища по ремеслу в основе фамилий — явление повсеместное.

Фамилия Вувуникян не относится к числу массовых и распространенных. Её носители встречаются в основном в Армении, а также в армянских диаспорах России, Грузии и стран Ближнего Востока. В силу редкости основы, фамилия представляет интерес для этимологов: она демонстрирует, как от короткого, почти звукоподражательного корня через цепочку суффиксов (Вув — Вувик — Вувуник — Вувуникян) образуется полноценная родовая фамилия.