Фамилия Выбодовский — редкая, шляхетская по модели, но с корнем, который уводит не в гербовый зал, а в крестьянский быт. Её основа — польское или западнорусское слово «выбодать». В говорах это означало «выдолбить», «выковырять», «выскрести». Так могли прозвать человека, который занимался долблением — например, выдалбливал лодки-однодревки, корыта, ульи или деревянные желоба. Прозвище Выбода (или Выбод) давали и тому, кто работал с долотом, и тому, кто «выбодал» себе путь настойчивостью или скандальностью.

Суффикс -овский типичен для польской и западнорусской ойконимической модели: фамилию давали по названию имения или местечка. То есть Выбодовский — это «тот, кто из Выбодова» или «владелец Выбодова». А само название Выбодово могло возникнуть от фамилии первого поселенца или от места, где долбили лес. В польских источниках подобные топонимы (Bodów, Bodzewo) встречаются, но именно Выбодово — крайне редкое название, что делает фамилию штучной.

Фамилия могла возникнуть и чисто прозвищным путём: без топонима, напрямую от прозвища Выбода — с добавлением -овский по аналогии с дворянскими фамилиями. В XVIII–XIX веках так нередко «облагороживали» простонародные основы, придавая им панское звучание. Поэтому Выбодовский — это не обязательно потомок шляхтича: скорее, человек из семьи, где ремесло плотника или бондаря передавалось по наследству, а фамилию зафиксировали уже в документах Российской империи.

Встречается фамилия в основном на территории бывшей Речи Посполитой: в современных Польше, Беларуси, на западе Украины. В России — единичные носители, часто потомки переселенцев конца XIX века. Ударение, судя по польской модели, падает на второй слог: Выбо́довский.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Бодовский, Выбодов — показывает, что основа «бод-» (от «бодать», «колоть») в русских и польских фамилиях встречается, но с приставкой «вы-» даёт именно значение «выдолбленный», а не «бодливый». Это редкий случай, когда прозвище по инструментальному ремеслу закрепилось в шляхетской форме.