Фамилия Ябодух — редкая и нестандартная для русского уха. В ней нет привычных фамильных суффиксов (-ов, -ин, -ский), поэтому она сразу привлекает внимание своей «необработанностью». Скорее всего, перед нами застывшее прозвище, которое перешло в фамилию без изменений, в той форме, в какой его дали первому носителю.

Корень фамилии, «Ябод-», не имеет очевидных славянских параллелей. Самое правдоподобное объяснение — искусственное или заимствованное происхождение. В украинском и белорусском языках есть слово «ябіда» (ят, ябеда, доносчик), но финаль «-ух» сюда не ложится. Зато в польском и западноукраинских говорах существует глагол «jabłuchać» или «jabłuchnąć» — в диалектах так могли называть процесс жевания, чавканья или невнятной речи. Таким образом, «Ябодух» могло быть прозвищем человека, который говорил неразборчиво, «жевал слова», или, напротив, был любителем поесть с характерным звуком.

Другая, более экзотическая версия отсылает к тюркским корням. В языках Поволжья (татарском, башкирском) есть основа «яба» или «ябы» — плохой, негодный, а также «дух» (друг, товарищ). Сложение могло дать прозвище «Яба-дух» — «плохой друг», «ненадёжный товарищ». Однако это лишь гипотеза, так как фамилия не фиксируется в тюркских ареалах массово.

Географически фамилия Ябодух встречается единично, в основном на западе России и в Беларуси. Можно предположить, что предки носителя были крестьянами или мещанами, получившими прозвище от соседей за какую-то заметную черту — манеру есть, говорить или за характер. В официальных документах фамилию записали так, как услышали, без адаптации под стандартные модели. Это делает её одной из тех «живых» фамилий, где прозвищная основа не стёрлась суффиксом, а осталась в исходном, грубоватом виде.