Фамилия Яемговно — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с тем, как её слышат. Это так называемая «говорящая» фамилия, образованная от прозвища или, точнее, от устойчивой фразы, ставшей именем собственным. Основа здесь — конструкция «я ем говно», которая в древнерусской или диалектной речи могла звучать как «я ем говно» или «яем говно». Скорее всего, прозвище закрепилось за человеком с неразборчивым вкусом, нечистоплотным в еде, либо за тем, кто занимался вывозом нечистот или работал с отбросами — в средневековой Руси такие занятия давали яркие, часто уничижительные прозвища, которые затем переходили в фамилии.

Суффикс «-овно» здесь нестандартный. Обычно фамилии образуются через суффиксы принадлежности: -ов, -ев, -ин. В данном случае «-овно» — это, вероятно, результат сращения фразы с окончанием, которое придало ей форму прилагательного или существительного среднего рода, но в фамилии закрепилось как цельное слово. Более логичная модель — через суффикс «-ов», то есть «Яемговнов», но на практике встречается именно такая запись, что может указывать на запись фамилии «на слух» в документах XIX века, когда писарь не стал менять звучание.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России, где были распространены «говорящие» фамилии на основе бытовых сценок (сравните: Непейвода, Подопригора, Убейкобыла). Встречается она крайне редко, в основном в сельской местности. В ономастической литературе, например в работах Б. Унбегауна, подобные фамилии рассматриваются как «прозвищные», образованные от глагольных форм. Поскольку фамилия недвусмысленная, её носители в прошлом, скорее всего, принадлежали к крестьянскому или мещанскому сословию — дворяне такие прозвища не носили.

Споров о происхождении здесь почти нет: версия с фразой «я ем говно» — единственная правдоподобная. Альтернативные гипотезы (например, от тюркского корня или искажённого имени) не выдерживают критики из-за прозрачной семантики. Если искать однокоренные фамилии, то ближе всего стоят Яемов, Емов, Говнов — но Яемговно стоит особняком как сложное, составное образование.