Фамилия Янанец — редкий пример, в котором славянская модель столкнулась с неславянской основой. Скорее всего, перед нами украинская или западнорусская фамилия, образованная по продуктивной модели: основа + суффикс -ец. В украинской ономастике суффикс -ец часто указывал на происхождение из определенного места или на принадлежность к какой-то группе людей (ср. Донец, Харьковец, Полтавец).

Основа «Ян» — это одна из форм имени Иван, распространенная у западных славян (поляков, чехов, словаков) и в западных регионах Украины (Галиция, Буковина). Имя Ян в этих краях было столь же обычным, как Иван в центральной России. Соответственно, «Янанец» — это «сын Яна» или «человек из рода Яна», но с местным, региональным оттенком. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев (Янов), украинская форма на -ец сохранила более архаичную и «именную» конструкцию.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: фамилия могла возникнуть от названия населенного пункта. Например, в Польше и на Западной Украине есть села с корнем «Ян» (Янов, Янув). Тогда Янанец — это выходец из такого села («яновский»).

В любом случае, фамилия подсказывает, что предки носителя жили или были родом с западнославянской или галицкой территории, где имя Ян было обиходным, а фамилии на -ец — обычным делом. В России эта фамилия встречается редко, что подтверждает её локальное, западное происхождение.