Фамилия Янковецкий образована от имени Янок, польской формы канонического имени Иоанн. Имя имеет древнееврейское происхождение и переводится на русский язык как «Бог помиловал». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Янок, со временем получил фамилию Янковецкий.