Фамилия Япэрэ настолько редкая, что её происхождение приходится реконструировать по общим законам русской ономастики, а не по готовым справочным данным. Её звучание и написание сразу выдают нерусский корень. Скорее всего, это русифицированная форма фамилии, принесённой переселенцами с Кавказа, из Средней Азии или Поволжья, где распространены языки тюркской или иранской групп.

Разберём словообразовательную модель. Фамилия оканчивается на -э. В русском языке фамилии с таким окончанием — редкость, обычно это застывшая форма местного падежа или прямой перенос иноязычной основы без добавления типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Сравните с фамилиями типа Дурново, Черных, но там ударение иное. В случае Япэрэ, скорее всего, перед нами фамилия, не прошедшая полную русификацию: её носители, попав в русскоязычную среду, сохранили исходное звучание, а при записи в документах (например, в метрических книгах или советских паспортах) закрепилось именно такое написание.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, чувашском, казахском) есть корень «яп» или «йап», означающий «делать», «мастерить», «строить». Форма «япэрэ» может быть диалектным вариантом причастия или деепричастия (вроде «делающий», «строящий») либо производным от него прозвищем. В таком случае предок носителя фамилии был ремесленником, строителем или мастером на все руки. Менее вероятна, но возможна связь с чувашским словом «япăр» (добротный, хороший) — тогда прозвище могло характеризовать человека как добросовестного или удачливого.

Вторая версия — иранская (осетинская или таджикская). В осетинском языке есть корень «йæппæр» или близкие к нему звучания, обозначающие действие «бросать», «кидать». В таком случае прозвище могло относиться к метателю копья или камней, либо — в переносном смысле — к человеку резкому, размашистому в движениях. Однако эта гипотеза слабее тюркской, так как фамилия Япэрэ не фиксируется в известных списках осетинских фамилий.

Географически фамилия могла возникнуть в районах смешанного русско-тюркского населения: в Приуралье, в Оренбургской области, в Татарстане или Башкортостане. Именно там в XIX веке активно шёл процесс записи инородческих фамилий в русские метрики, и многие из них получили необычное для русского уха окончание. По сословию предки, скорее всего, относились к государственным крестьянам или казакам — в среде дворянства такие экзотические фамилии почти не встречались.

Сегодня фамилия Япэрэ — большая редкость. Если вы её носитель, то почти наверняка принадлежите к одной локальной ветви, возможно, даже к одному роду. Поиск по архивам стоит начинать с переписей конца XIX века по Оренбургской или Уфимской губерниям, обращая внимание на варианты написания: Япэре, Япера, Япыре.