Фамилия Яполутор — один из тех редких случаев, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не зашифровано. Она буквально читается как «я полтора», то есть «я — полтора человека». Такие прозвища давали рослым, сильным людям, которые выделялись физической мощью или ростом, словно заменяя собой двоих. В крестьянской среде, где ценность работника измерялась его силой, подобное именование было не обидным, а уважительным: «полтора мужика» — значит, и в поле, и в драке надёжный.

Географически фамилия почти наверняка из северо-западных или центральных областей России. Форма «Яполутор» с ударением на втором слоге (Я-полу́тор) — типично русская, без украинского или белорусского смягчения. Суффикс отсутствует: фамилия застыла в виде чистого прозвища, что встречается нечасто. Обычно такие фамилии давали либо однодворцам (государственным крестьянам юга), либо жителям отдалённых деревень, где фамилии фиксировали поздно и не успели «причесать» под стандартные -ов или -ин.

Можно предположить и более прозаичную версию: прозвище могли дать человеку, который работал за двоих, но получал паёк на полторы доли. Или же — тому, кто носил одежду полуторного размера, нестандартную. Но основная версия — именно рост и сила, поскольку в русских говорах «полтора человека» — устойчивый фразеологизм для обозначения богатыря.

В дореволюционных переписях фамилия не встречается массово. Встретить её можно в единичных записях по Вологодской, Костромской и Нижегородской губерниям. В современной России носителей крайне мало, что делает фамилию ценной для генеалогов: найти однофамильцев почти наверняка означает найти родственников.

Словообразовательно фамилия уникальна тем, что в ней нет суффикса принадлежности. Это не «чей-то» (Яполуторов), а «кто». Такая модель — «чистое» прозвище в роли фамилии — характерна для самых ранних пластов русских фамилий, которые возникли ещё до XVI века, когда человека могли записать по уличному имени без изменений.