Фамилия Ярмагомедов — одна из тех, где основа говорит сама за себя, а суффикс лишь оформляет её в патроним. Это типичная русская фамилия, образованная от личного имени Ярмагомед, которое, в свою очередь, является переработкой арабского имени Ярмагомед (или Яр-Магомед). Первая часть «Яр» восходит к тюркскому «яр» — друг, близкий, любимый, а «Магомед» — это народная форма имени Мухаммад. В сумме имя означает «любимый Мухаммад» или «друг Мухаммада», что указывает на религиозный контекст: так могли назвать мальчика в мусульманской семье, подчёркивая его близость к пророку.

Модель образования фамилии проста и распространена в среде народов Северного Кавказа и Поволжья, где русский суффикс -ов добавили к восточному имени. В отличие от исконно русских фамилий на -ов, где основа — прозвище или профессия, здесь в основе — личное имя отца. То есть Ярмагомедов буквально означает «сын Ярмагомеда». Такие фамилии массово фиксировали в XIX — начале XX века, когда имперская администрация переписывала мусульманское население и оформляла патронимы по русскому образцу.

Географически фамилия Ярмагомедов почти наверняка привязана к Дагестану, Чечне или Ингушетии. Имя Ярмагомед (встречается также как Ярмагомед) особенно характерно для аварцев и кумыков. В русских переписях XIX века такие имена нередко записывали на слух, поэтому возможны варианты написания: Ярмагомедов, Ярмаметов, Ярмагомедов. Но именно форма с «г» и «д» — самая устойчивая, так как она ближе к арабскому оригиналу.

С точки зрения сословной принадлежности, предки носителей фамилии могли быть как крестьянами, так и узденями (свободными общинниками) или даже военными. В горских обществах имя Ярмагомед не было признаком знатности, но указывало на религиозную традицию. Фамилия не имеет отношения к русскому слову «ярмо» или чему-то связанному с трудом — это чисто антропонимический случай, когда экзотическое для русского уха имя превратили в фамильный суффикс.

Редкость фамилии в том, что она сохранила исходное ударение на второй слог: Ярмагоме́дов, хотя в бытовой речи иногда смещают на третий. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) такие образования не рассматриваются подробно, так как они относятся к региональным, а не общерусским моделям. Тем не менее, для носителя фамилия — прямой маркер дагестанского или чеченского происхождения с отсылкой к исламской культуре.