Фамилия Ярунец — редкая и структурно прозрачная, но неоднозначная по корню. Она образована с помощью уменьшительно-притяжательного суффикса -ец, который в русских фамилиях часто указывал на происхождение от прозвища или географического названия (ср. Донец, Терновец). Основа — «Ярун». Это либо древнерусское нецерковное имя Ярун, либо прозвище от прилагательного «ярый» — горячий, вспыльчивый, ретивый. В древнерусском языке «ярун» означало человека в состоянии ярости, гнева, а также самца животных в период брачного возбуждения (отсюда «яровой»). Таким образом, Ярунец — «сын Яруна» или «маленький Ярун».

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с топонимом. В Польше и Беларуси есть несколько деревень под названием Яруны (например, в Гродненской области). Переселенец из такого села мог получить прозвище Ярунец — «выходец из Ярунов». Однако суффикс -ец в фамилиях чаще указывает на личное имя, чем на географию, поэтому версия с прозвищем предпочтительнее.

Фамилия Ярунец встречается в основном на западе России, в Беларуси и на Украине — в областях, где был силён балто-славянский языковой контакт. В польском языке слово «jarun» (от «jary») также означало «ярый», что поддерживает первую гипотезу. Социальный контекст: носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьян или мещан — фамилии на -ец редко встречаются среди дворянства, так как они не образовывались по модели притяжательных прилагательных на -ов/-ев.

Ономастический словарь Б. Унбегауна не упоминает Ярунец, но разбирает модель с суффиксом -ец от основ на -ун (например, Бегун — Бегунец). Это подтверждает, что фамилия вписана в стандартную словообразовательную схему. Известных носителей с этой фамилией в открытых источниках нет, что делает её типичным примером редкой микрофамилии, сохранившейся в локальных родах.