Фамилия Яуаыа выглядит как аномалия для русского письма. В ней нет ни одного гласного звука, привычного для славянской фонетики, а сочетание «ыа» совершенно нетипично. Скорее всего, мы имеем дело с записью фамилии одного из народов Северного Кавказа, Закавказья или тюркского мира, где встречаются подобные звуковые ряды. Например, в адыгских, абхазских или дагестанских языках есть гортанные и фарингальные согласные, которые при попытке передать их кириллицей дают такие странные буквосочетания. Вероятнее всего, исходная фамилия звучала как Яуа (или Йауа) с каким-то гортанным призвуком на конце, который в русской записи превратился в «ыа».

Если отбросить искажения, основа «Яуа» может восходить к имени или прозвищу. В некоторых тюркских языках «яу» означает «враг», «противник», а суффикс «-а» делает слово личным именем — «Враг» как прозвище воина или защитника. В адыгской среде встречается имя Яуа, связанное с понятием «войско» или «воин». То есть фамилия могла означать «принадлежащий воину» или «сын воина». Однако из-за искажения письма точную этимологию назвать трудно: в документах XIX — начала XX века, когда русские чиновники записывали инородческие фамилии на слух, такие варианты возникали сплошь и рядом. Сравните с реальными фамилиями: Яушев (татарская, мордовская), Яуров (из «яур» — «злой» в тюркских языках) или Яуа (кабардинская). Яуаыа — это, скорее всего, их крайняя, почти нечитаемая форма.

Фамилия не имеет славянского суффикса -ов/-ев, -ин или -ский, что сразу указывает на её нерусское происхождение. Встретить её можно только в местах компактного проживания народов Кавказа или в среде тюркских народов Поволжья, где сохраняются архаичные записи. Носители такой фамилии, вероятно, вели род от людей, получивших прозвище за воинский нрав или охрану границ. Сегодня фамилия Яуаыа крайне редка, и её главная ценность — как свидетельство того, как сложно передать звуки горских языков русской азбукой.