Фамилия Ынтыкбаев — редкий пример, где сразу бросается в глаза начальная буква «Ы», почти не встречающаяся в исконно русских фамилиях. Это верный признак тюркского происхождения, и разбор здесь нужно начинать не с корня, а с географии и этнической принадлежности. Фамилия образована по типичной для казахской и киргизской ономастики модели: личное имя или прозвище плюс компонент «бай», а затем русский суффикс принадлежности «-ев», который добавился при документировании фамилии в Российской империи.

Основа фамилии — составное имя Ынтыкбай. Первая часть, «ынтык» (или «ынтығу»), в казахском и киргизском языках означает «стремление», «рвение», «жажда», а также «вдохновение». Вторая часть, «бай», — один из самых распространённых компонентов в тюркских именах, изначально означавший «богач», «господин», «хозяин», но со временем превратившийся в пожелательный элемент, придающий имени значение «богатый чем-либо» или «обладающий чем-либо». Таким образом, Ынтыкбай — это имя-пожелание: «обладающий стремлением», «богатый рвением» или «вдохновенный господин». Родители, давая такое имя, желали сыну целеустремлённости и успеха в начинаниях.

Модель образования здесь двойная. Сначала тюркская: от нарицательного «ынтык» и титула «бай» сложилось личное имя Ынтыкбай. Затем, в XIX–XX веках, при переходе к паспортной системе, к этому имени добавили русский патронимический суффикс «-ев» (вариант «-ов» после мягких и шипящих основ, но здесь — после гласной «й»). Фамилия Ынтыкбаев буквально означает «потомок Ынтыкбая». Интересно, что в самой фамилии ударение, скорее всего, падает на последний слог — Ынтыкба́ев, что тоже выдает её нерусское происхождение, так как в исконных фамилиях ударение редко падает на суффикс.

В отличие от многих фамилий, где можно спорить о корне, здесь этимология прозрачна. Спорных версий практически нет: основа «ынтык» в тюркских языках устойчива и не имеет иных значений, которые могли бы привести к прозвищу. Это исключительно именная фамилия, а не прозвищная по роду занятий или внешности. Социально предки носителя фамилии были, скорее всего, кочевниками-скотоводами или земледельцами в казахских или киргизских степях, а фамилия закрепилась за родом уже в оседлый период, когда началась массовая фиксация фамилий у тюркских народов Российской империи.