Фамилия Йонуйтите звучит для русского уха необычно, и это не случайно: она имеет литовское происхождение. Её основа — мужское имя Йонас (литовский аналог библейского Иона, означающего «голубь»). Суффикс -уйтите указывает на женский род и принадлежность: в литовской традиции так образовывали фамилии для незамужних дочерей или жён. Буквально Йонуйтите — «дочь Йонаса» или «женщина из рода Йонасов».

Это типичная патронимическая модель, характерная для литовской ономастики XIX — начала XX века. В Литве фамилии с таким окончанием (как и с -ите, -уте) встречаются повсеместно, особенно в северных и центральных регионах. Если ваш предок носил фамилию Йонуйтите, то, скорее всего, он был литовцем или происходил из семьи, жившей на территории бывшего Великого княжества Литовского (современные Литва, запад Беларуси, часть Польши).

В русском языке фамилия сохранила литовское окончание, что редкость: обычно при русификации такие фамилии меняли на Йонайтис или Йонас. Йонуйтите — знак того, что носительница или её предки не утратили связь с родным языком. Встречается она в основном в Литве и у литовской диаспоры, а в России — единично, у потомков литовцев, переселившихся в XIX веке.

Разбор по компонентам: корень Йон- (от Йонас), суффикс -уйт- (указывает на происхождение от мужского имени) и окончание -е (женский род). Это не прозвище и не ремесло, а чисто родовая метка. Если сравнивать с русскими аналогами, то ближе всего фамилии вроде Иванова или Петрова, но с обратной логикой: у нас — «чья?», а в литовском — «дочь кого?».