Фамилия Юкинина — редкая и неочевидная для разбора. На первый взгляд она похожа на типичную «материнскую» фамилию с суффиксом -ин, но на деле её происхождение упирается в одну деталь: ударение. Если фамилия произносится с ударением на второй слог — Юки́нина, то в её основе лежит женское имя Юки́на. Это уменьшительная форма от канонического имени Евдокия (в народном произношении — Овдотья, Авдотья). В некоторых говорах имя Юкина бытовало как самостоятельное: так ласково называли девочку, и со временем форма закрепилась в документах. Следовательно, Юкинина — это «дочь или жена Юкины», то есть женщина, чей муж или отец носил прозвище Юкина (или сам был Юкиной по матери).

Второй вариант — ударение на первый слог: Ю́кинина. Тогда основа — редкое прозвище Ю́киня. Оно могло произойти от диалектного глагола «юкать» — издавать резкий звук, кричать (в рязанских и тульских говорах) или от «юк» — так в некоторых областях называли рыбу голавль. Прозвище Юкиня дали бы крикливому человеку либо ловкому рыбаку. Суффикс -ин в этом случае указывает на принадлежность к роду: Юкинины — потомки Юкини.

С географической привязкой всё скупо: фамилия встречается в основном в центральных областях России (Тверская, Ярославская, Московская области), но единично. Ни в одном из известных словарей русских фамилий (Унбегаун, Никонов, Веселовский) Юкинина не упоминается — это не массовая фамилия, а локальная и, вероятно, поздняя по фиксации. В метрических книгах XIX века она могла писаться как Юкининъ с твёрдым знаком на конце, а женская форма Юкинина появлялась уже при записи женщин или вдов.

Спор между двумя версиями решается просто: если в вашей семье передают, что фамилия от имени, — это почти наверняка Евдокия. Если же фамилия кажется «прозвищной» и вы знаете, что предки жили в деревне у реки или славились громким голосом, — версия с юканьем или рыбой правдоподобнее. Третьего, как обычно, не дано.