Фамилия Юкишь — редкий пример, когда окончание -ишь указывает не на польский или украинский след, а на патронимическую модель, характерную для северо-западных русских говоров и, возможно, для литовско-белорусского пограничья. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев или -ин, форма на -ишь (как и на -их, -ых) закрепляла прозвище или имя отца в неизменяемом виде: «чей?» — Юкишь, то есть «сын Юки». Основа Юк- — это усечённая или диалектная форма от канонического имени Юрий (в просторечии Егор, Юрка). Подобное стяжение встречается в белорусских и псковских говорах: Юк вместо Юрк или Юрко.

Вторая версия, менее распространённая, но не менее правдоподобная, связывает основу с литовским личным именем Jukis или Jukas (уменьшительное от Jurgis — Юрий). В регионах бывшего Великого княжества Литовского (современные Гродненская, Витебская области, а также Смоленщина) фамилии с балтскими корнями не редкость, и суффикс -ишь мог приспособить литовское окончание к славянской модели. Таким образом, Юкишь могло означать «потомок литвина Юкиса».

Географически фамилия сегодня встречается единично — в основном в Беларуси и на западе России, что подтверждает её локальное происхождение. Суффикс -ишь в русской ономастике не образовывал сословных фамилий (дворянских или купеческих), а бытовал в крестьянской и мещанской среде, где сохранялись архаичные формы именования по отцу. В документах XIX века такую фамилию могли записать как Юкиш или Юкишев, но вариант с твёрдым -шь устоялся именно в устной традиции, что делает её ценным маркером северо-западного диалектного ареала.