Фамилия Юкоганов — один из тех случаев, когда этимология упирается в стену, но стена эта не глухая. Судя по всему, перед нами русская фамилия, образованная по стандартной патронимической модели от прозвища или имени Юкоган. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Юкогана». Вопрос упирается в то, что такое само слово Юкоган.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение основы. В татарском, башкирском и других тюркских языках слово «юк» (йук) означает «нет», «отсутствует», а также может передавать понятие бедности или недостатка. Компонент «-ган» — распространенный тюркский аффикс, образующий причастия или прилагательные. Таким образом, Юкоган могло означать «тот, у кого ничего нет», «неимущий», «обедневший». Прозвище давали человеку без достатка, а потом оно закрепилось за его потомками. Альтернатива — личное имя Юкоган, которое могло быть охранительным: чтобы злые силы не позарились на ребенка, его нарекали именем с «отрицательным» значением, «пустым» или «нищим» — такая практика известна у многих народов.

Менее убедительная, но возможная версия — связь с диалектным русским словом «юк» или «юкать». В некоторых говорах «юк» — это звук, крик, или даже вид рыбы (юкса). Но прибавка «-ган» для чисто русского прозвища нетипична, поэтому тюркский след выглядит логичнее.

География фамилии сегодня довольно размыта, но корни, скорее всего, ведут в Поволжье или Приуралье — регионы активного контакта русских с тюркскими народами. Носители фамилии могли быть крестьянами, посадскими людьми или казаками, получившими прозвище за «пустой карман». Дворянских родов с такой фамилией в известных родословных книгах не зафиксировано — это подкрепляет версию о простонародном происхождении.

В написании стоит обратить внимание на ударение: скорее всего, оно падает на последний слог — Юкога́нов, как и в большинстве фамилий на -анов. Фамилия редкая, в списках частотных русских фамилий она не встречается, что делает её особенно ценной для локальной генеалогии. Если ваши предки — Юкогановы, искать их стоит среди крестьянского или мещанского сословия восточных губерний Российской империи.