Фамилия Юняткин — один из тех редких случаев, когда основа сразу уводит в прошлое, но не даёт однозначного ответа. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Юнятка — так в быту могли называть главу семьи, а его дети становились Юняткиными. Вопрос в том, что скрывается за самим именем Юнятка.

Самая вероятная версия — это производное от крестильного имени Юний. В святцах есть несколько святых с таким именем, но в народе полная форма приживалась редко. Уменьшительный вариант Юнятка образовывали по той же модели, что и Ванятка от Иван, Сенятка от Семён. Мягкое окончание и суффикс -к- делали имя домашним, а в документах XVII–XVIII веков такие формы часто фиксировались как полноценные прозвища. Если ваш предок в переписи значился Юняткой, значит, его отца звали Юнием — имя редкое, но не уникальное для духовного сословия или мещанской среды.

Вторая гипотеза, менее распространённая, но имеющая право на существование, — связь с диалектным словом «юнять» или «юнеть». В некоторых говорах так говорили о молодом, неопытном человеке, почти подростке. Юнятка могло быть прозвищем младшего сына или подмастерья, которого так и прозвали за возраст. Но эта версия слабее: глагол «юнеть» известен в литературном языке, а вот прозвищной формы от него почти не встречается в старых писцовых книгах.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России — там, где чаще попадались редкие календарные имена. Встречается она и сегодня, но остаётся малочисленной, что подтверждает её происхождение от личного имени, а не от массового ремесла или профессии.

Если сравнивать с однокоренными — Юняев, Юньков, Юнин — Юняткин стоит особняком именно из-за суффикса -к-, который превращает имя в ласкательную форму. Это не фамилия дворянская и не купеческая: скорее всего, её носили крестьяне или церковнослужители, где такие уменьшительные имена давали детям постоянно.