Фамилия Юркутов — редкая и звучит нестандартно для русского уха. Если разложить её по модели, сразу становится ясно, что перед нами типичная русская фамилия на -ов, но с необычной основой. Такая модель характерна для фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -ут, -ют.

Вероятнее всего, в основе лежит прозвище Юркут. Его можно связать с диалектным глаголом «юркать» — нырять, быстро прятаться, шмыгать. В русских говорах «юркий» означает проворный, изворотливый, пронырливый. Человек с таким прозвищем мог получить его за подвижность, способность быстро ускользать или ловко выполнять работу. Суффикс -ут в прозвищах нередко придаёт оттенок действия или свойства, как в словах «вертун», «болтун», но в более краткой, усечённой форме.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от канонического имени Юрий или его просторечной формы Юрка. В таком случае Юркут могло быть уменьшительно-ласкательным вариантом, а фамилия Юркутов означала бы «сын Юркута». Однако для имени Юрий более характерны фамилии Юрьев, Юрков, Юрин, а форма с -ут встречается реже и указывает скорее на прозвищное происхождение.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где диалектная лексика с корнем «юр-» была распространена. Встречается она в основном в единичных записях, что говорит о локальном бытовании — вероятно, родоначальник был известен под этим прозвищем в пределах одной деревни или волости.

Словообразовательно фамилия проста: основа Юркут + патронимический суффикс -ов. Никаких дополнительных приставок или сложных суффиксов нет, что характерно для фамилий, сложившихся в крестьянской среде в XVII–XVIII веках. Сословно предки Юркутовых, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, а не дворянами — фамилия не попала в родословные книги и не имеет «княжеских» или «боярских» окончаний.