Фамилия Юстелис — редкий случай в русском ономастиконе. Её происхождение почти наверняка не славянское, а прибалтийское или финно-угорское. В первую очередь обращает на себя внимание окончание -ис, которое характерно для литовских и латышских фамилий. В русской среде такие фамилии могли появиться либо через браки, либо при переселении народов из западных губерний Российской империи.

Основа фамилии — Юстел- — восходит, скорее всего, к личному имени Юстин или Юстас (от латинского justus — «справедливый»). В прибалтийских языках это имя могло принять форму Justelis или Juste, а суффикс -ис в латышском языке указывает на принадлежность или происхождение: буквально «сын Юстеля» или «из рода Юстелей». Таким образом, первый носитель фамилии был, вероятно, потомком человека по имени Юстель — уменьшительной формы от Юстас.

Географически фамилия Юстелис почти не встречается за пределами Латвии и Литвы, а в России её можно найти лишь в единичных записях, преимущественно в северо-западных областях или в среде потомков латышских переселенцев XIX — начала XX века. В сословном отношении предки-носители такой фамилии чаще всего были крестьянами или мещанами — дворянство в Прибалтике обычно носило немецкие фамилии на -берг, -дорф, а латышские и литовские фамилии на -ис закрепились именно за простыми людьми после отмены крепостного права.

Интересная деталь: в латышском языке фамилия могла писаться как Justelis, а русское написание Юстелис — результат транслитерации, где начальное «Ю» соответствует звуку «Ю» в латышском. Встречаются варианты Юстелис, Юстелис, но без ударения на последний слог — в латышском ударение почти всегда на первом слоге, так что правильно произносить Юстелис. Фамилия не имеет никакого отношения к русским суффиксам -ов или -ин, что сразу отличает её от подавляющего большинства русских фамилий.